過濾棉是使用最普便的一種濾材，，具良好的滲透性。是一種合成材料，呈絲狀柔軟，作為過濾床的外(上)層鋪設材料，它對水中的懸浮物具有良好的吸附能力，并能蘊藏大量的耗氧生化菌。水流經濾材可以濾除水中絮凝的大顆粒雜質，提高水的透明度，其粗糙且布滿小孔隙的表面，可吸附大量硝化細菌，并供其生長繁殖，以分解水中氨、亞硝酸鹽等有機物，可同時具備物理和生物過濾兩種功能。當濾棉表面雜質污物積累過多時，稍稍清洗即可繼續使用。過濾棉纖維較穩定，長期使用也不會互相粘合和縮小而變形，較其它濾材既不易腐爛又耐用，但為了不影響過濾效果，使用到一定程度也需要更換。過濾棉可以用作過濾介質的第一層，也可用作最后一層，大多數情況下置于起始層以濾除大部分較粗的臟顆粒，使下層過濾介質不致于太臟，從而提高過濾效果。在過濾器中，過濾棉安放厚度要適中，既不能影響水流通過，又要獲得良好的過濾效果。